考古学者インディアナ・ジョーンズは米国情報部の依頼で、ナチスドイツが狙う秘宝の探索に出掛ける。その秘宝とは恐ろしい力を持つと言われる黄金の聖櫃（アーク）。インディは手掛かりとなるペンダントを持つ恩師をネパールに訪ね…。